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| H (Match allé) | Dinamo Kiev | - | Feyenoord | 2:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Feyenoord | - | Dinamo Kiev | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 31.07.2012 19:00 | R (match retour): 07.08.2012 20:00 | vainqueur: Dinamo Kiev | ||||
| H (Match allé) | Motherwell FC | - | Panathinaikos | 0:2 (0:1) | ||
| R (match retour) | Panathinaikos | - | Motherwell FC | 3:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 31.07.2012 20:45 | R (match retour): 08.08.2012 20:45 | vainqueur: Panathinaikos | ||||
| H (Match allé) | BATE Borisov | - | Debreceni VSC | 1:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Debreceni VSC | - | BATE Borisov | 0:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 18:00 | R (match retour): 07.08.2012 20:30 | vainqueur: BATE Borisov | ||||
| H (Match allé) | Ironi Kiryat Shmona | - | Neftçi PFK | 4:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Neftçi PFK | - | Ironi Kiryat Shmona | 2:2 (1:0) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 18:30 | R (match retour): 08.08.2012 18:00 | vainqueur: Ironi Kiryat Shmona | ||||
| H (Match allé) | FC Sheriff | - | Dinamo Zagreb | 0:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Dinamo Zagreb | - | FC Sheriff | 4:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 19:00 | R (match retour): 08.08.2012 20:45 | vainqueur: Dinamo Zagreb | ||||
| H (Match allé) | Molde FK | - | FC Basel | 0:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | FC Basel | - | Molde FK | 1:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 19:00 | R (match retour): 08.08.2012 20:00 | vainqueur: FC Basel | ||||
| H (Match allé) | AEL Limassol | - | Partizan | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Partizan | - | AEL Limassol | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 19:45 | R (match retour): 08.08.2012 20:45 | vainqueur: AEL Limassol | ||||
| H (Match allé) | NK Maribor | - | F91 Dudelange | 4:1 (2:0) | ||
| R (match retour) | F91 Dudelange | - | NK Maribor | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:00 | R (match retour): 08.08.2012 17:00 | vainqueur: NK Maribor | ||||
| H (Match allé) | RSC Anderlecht | - | FK Ekranas | 5:0 (3:0) | ||
| R (match retour) | FK Ekranas | - | RSC Anderlecht | 0:6 (0:3) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:00 | R (match retour): 08.08.2012 19:00 | vainqueur: RSC Anderlecht | ||||
| H (Match allé) | FC København | - | Club Brugge KV | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Club Brugge KV | - | FC København | 2:3 (1:0) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:00 | R (match retour): 08.08.2012 20:30 | vainqueur: FC København | ||||
| H (Match allé) | CFR Cluj | - | Slovan Liberec | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Slovan Liberec | - | CFR Cluj | 1:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:45 | R (match retour): 08.08.2012 19:00 | vainqueur: CFR Cluj | ||||
| H (Match allé) | Śląsk Wrocław | - | Helsingborgs IF | 0:3 (0:1) | ||
| R (match retour) | Helsingborgs IF | - | Śląsk Wrocław | 3:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:45 | R (match retour): 08.08.2012 18:00 | vainqueur: Helsingborgs IF | ||||
| H (Match allé) | Celtic FC | - | HJK Helsinki | 2:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | HJK Helsinki | - | Celtic FC | 0:2 (0:0) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:45 | R (match retour): 08.08.2012 19:00 | vainqueur: Celtic FC | ||||
| H (Match allé) | Fenerbahçe | - | FC Vaslui | 1:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | FC Vaslui | - | Fenerbahçe | 1:4 (1:1) | ||
| H (Match allé): 01.08.2012 20:45 | R (match retour): 08.08.2012 20:00 | vainqueur: Fenerbahçe | ||||
