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| H (Match allé) | FC København | - | APOEL Nikosia | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | APOEL Nikosia | - | FC København | 1:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 16.08.2016 20:45 | R (match retour): 24.08.2016 20:45 | vainqueur: FC København | ||||
| H (Match allé) | Dinamo Zagreb | - | RB Salzburg | 1:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | RB Salzburg | - | Dinamo Zagreb | 1:2 (1:0, 1:1) ap | ||
| H (Match allé): 16.08.2016 20:45 | R (match retour): 24.08.2016 20:45 | vainqueur: Dinamo Zagreb | ||||
| H (Match allé) | FC Steaua Bucureşti | - | Manchester City | 0:5 (0:2) | ||
| R (match retour) | Manchester City | - | FC Steaua Bucureşti | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 16.08.2016 20:45 | R (match retour): 24.08.2016 20:45 | vainqueur: Manchester City | ||||
| H (Match allé) | AFC Ajax | - | FK Rostov | 1:1 (1:1) | ||
| R (match retour) | FK Rostov | - | AFC Ajax | 4:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 16.08.2016 20:45 | R (match retour): 24.08.2016 20:45 | vainqueur: FK Rostov | ||||
| H (Match allé) | BSC Young Boys | - | Bor. Mönchengladbach | 1:3 (0:1) | ||
| R (match retour) | Bor. Mönchengladbach | - | BSC Young Boys | 6:1 (3:0) | ||
| H (Match allé): 16.08.2016 20:45 | R (match retour): 24.08.2016 20:45 | vainqueur: Bor. Mönchengladbach | ||||
| H (Match allé) | PFC Ludogorets Razgrad | - | Viktoria Plzeň | 2:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Viktoria Plzeň | - | PFC Ludogorets Razgrad | 2:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 17.08.2016 20:45 | R (match retour): 23.08.2016 20:45 | vainqueur: PFC Ludogorets Razgrad | ||||
| H (Match allé) | Celtic FC | - | Hapoel Be'er Sheva | 5:2 (3:0) | ||
| R (match retour) | Hapoel Be'er Sheva | - | Celtic FC | 2:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 17.08.2016 20:45 | R (match retour): 23.08.2016 20:45 | vainqueur: Celtic FC | ||||
| H (Match allé) | Dundalk FC | - | Legia Warszawa | 0:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Legia Warszawa | - | Dundalk FC | 1:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 17.08.2016 20:45 | R (match retour): 23.08.2016 20:45 | vainqueur: Legia Warszawa | ||||
| H (Match allé) | FC Porto | - | AS Roma | 1:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | AS Roma | - | FC Porto | 0:3 (0:1) | ||
| H (Match allé): 17.08.2016 20:45 | R (match retour): 23.08.2016 20:45 | vainqueur: FC Porto | ||||
| H (Match allé) | Villarreal CF | - | AS Monaco | 1:2 (1:1) | ||
| R (match retour) | AS Monaco | - | Villarreal CF | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 17.08.2016 20:45 | R (match retour): 23.08.2016 20:45 | vainqueur: AS Monaco | ||||
