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| H (Match allé) | Dinamo Tbilisi | - | FK Vllaznia | 3:0 | ||
| R (match retour) | FK Vllaznia | - | Dinamo Tbilisi | 3:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 16:00 | R (match retour): 29.07.1998 17:00 | vainqueur: Dinamo Tbilisi | ||||
| H (Match allé) | Sileks Kratovo | - | Club Brugge KV | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Club Brugge KV | - | Sileks Kratovo | 2:1 (2:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 17:00 | R (match retour): 29.07.1998 20:30 | vainqueur: Club Brugge KV | ||||
| H (Match allé) | FK Kareda Siauliai | - | Maribor Teatanic | 0:3 (0:1) | ||
| R (match retour) | Maribor Teatanic | - | FK Kareda Siauliai | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 17:00 | R (match retour): 29.07.1998 18:00 | vainqueur: Maribor Teatanic | ||||
| H (Match allé) | Beitar Jerusalem | - | B36 Tórshavn | 4:1 (3:0) | ||
| R (match retour) | B36 Tórshavn | - | Beitar Jerusalem | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 17:00 | R (match retour): 27.07.1998 20:00 | vainqueur: Beitar Jerusalem | ||||
| H (Match allé) | FK Obilić | - | ÍBV Vestmannaeyjar | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | ÍBV Vestmannaeyjar | - | FK Obilić | 1:2 (1:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 17:00 | R (match retour): 29.07.1998 20:00 | vainqueur: FK Obilić | ||||
| H (Match allé) | FC Zimbru | - | Újpest FC | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Újpest FC | - | FC Zimbru | 3:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 17:00 | R (match retour): 29.07.1998 20:00 | vainqueur: Újpest FC | ||||
| H (Match allé) | ŁKS Łódź | - | FK Kapaz Gäncä | 4:1 (1:0) | ||
| R (match retour) | FK Kapaz Gäncä | - | ŁKS Łódź | 1:3 (0:1) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 18:00 | R (match retour): 29.07.1998 14:30 | vainqueur: ŁKS Łódź | ||||
| H (Match allé) | Skonto FC | - | Dinamo Minsk | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Dinamo Minsk | - | Skonto FC | 1:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 18:00 | R (match retour): 29.07.1998 17:00 | vainqueur: Skonto FC | ||||
| H (Match allé) | HJK Helsinki | - | FK Yerevan | 2:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | FK Yerevan | - | HJK Helsinki | 0:3 (0:2) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 18:00 | R (match retour): 29.07.1998 16:00 | vainqueur: HJK Helsinki | ||||
| H (Match allé) | Dinamo Kiev | - | Barry Town FC | 8:0 (4:0) | ||
| R (match retour) | Barry Town FC | - | Dinamo Kiev | 1:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 19:00 | R (match retour): 29.07.1998 20:30 | vainqueur: Dinamo Kiev | ||||
| H (Match allé) | Grasshopper Club Zürich | - | Jeunesse Esch | 6:0 (3:0) | ||
| R (match retour) | Jeunesse Esch | - | Grasshopper Club Zürich | 0:2 (0:2) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 19:30 | R (match retour): 29.07.1998 20:00 | vainqueur: Grasshopper Club Zürich | ||||
| H (Match allé) | AFC Steaua București | - | FC Flora | 4:1 (2:1) | ||
| R (match retour) | FC Flora | - | AFC Steaua București | 3:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 19:45 | R (match retour): 29.07.1998 16:00 | vainqueur: AFC Steaua București | ||||
| H (Match allé) | Valletta FC | - | Anorthosis Famagusta | 0:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Anorthosis Famagusta | - | Valletta FC | 6:0 (3:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 20:00 | R (match retour): 29.07.1998 20:00 | vainqueur: Anorthosis Famagusta | ||||
| H (Match allé) | PFC Litex Lovech | - | Halmstads BK | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Halmstads BK | - | PFC Litex Lovech | 2:1 (2:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 20:15 | R (match retour): 29.07.1998 20:00 | vainqueur: PFC Litex Lovech | ||||
| H (Match allé) | Cliftonville FC | - | 1. FC Košice | 1:5 (1:3) | ||
| R (match retour) | 1. FC Košice | - | Cliftonville FC | 8:0 (3:0) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 20:30 | R (match retour): 29.07.1998 19:00 | vainqueur: 1. FC Košice | ||||
| H (Match allé) | Celtic FC | - | St Patrick's Athletic | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | St Patrick's Athletic | - | Celtic FC | 0:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 22.07.1998 20:45 | R (match retour): 29.07.1998 20:45 | vainqueur: Celtic FC | ||||
