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| H (Match allé) | Dinamo Tbilisi | - | Athletic Bilbao | 2:1 (2:0) | ||
| R (match retour) | Athletic Bilbao | - | Dinamo Tbilisi | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 17:00 | R (match retour): 26.08.1998 20:30 | vainqueur: Athletic Bilbao | ||||
| H (Match allé) | Galatasaray | - | Grasshopper Club Zürich | 2:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Grasshopper Club Zürich | - | Galatasaray | 2:3 (1:2) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 18:00 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: Galatasaray | ||||
| H (Match allé) | HJK Helsinki | - | FC Metz | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | FC Metz | - | HJK Helsinki | 1:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 18:00 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: HJK Helsinki | ||||
| H (Match allé) | Dinamo Kiev | - | AC Sparta Praha | 0:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | AC Sparta Praha | - | Dinamo Kiev | 1:3 (0:0, 0:1, 0:1) tab | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 19:00 | R (match retour): 26.08.1998 20:15 | vainqueur: Dinamo Kiev | ||||
| H (Match allé) | 1. FC Košice | - | Brøndby IF | 0:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Brøndby IF | - | 1. FC Košice | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 19:00 | R (match retour): 26.08.1998 20:10 | vainqueur: Brøndby IF | ||||
| H (Match allé) | AFC Steaua București | - | Panathinaikos | 2:2 (1:1) | ||
| R (match retour) | Panathinaikos | - | AFC Steaua București | 6:3 (3:2) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 19:45 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: Panathinaikos | ||||
| H (Match allé) | Rosenborg BK | - | Club Brugge KV | 2:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Club Brugge KV | - | Rosenborg BK | 4:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:15 | R (match retour): 26.08.1998 20:15 | vainqueur: Rosenborg BK | ||||
| H (Match allé) | PFC Litex Lovech | - | Spartak Moskva | 0:5 (0:0) | ||
| R (match retour) | Spartak Moskva | - | PFC Litex Lovech | 6:2 (3:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:15 | R (match retour): 26.08.1998 17:00 | vainqueur: Spartak Moskva | ||||
| H (Match allé) | Maribor Teatanic | - | PSV Eindhoven | 2:1 (1:0) | ||
| R (match retour) | PSV Eindhoven | - | Maribor Teatanic | 4:1 (1:1, 2:1, 4:1) ap | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:15 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: PSV Eindhoven | ||||
| H (Match allé) | Olympiakos Piraeus | - | Anorthosis Famagusta | 2:1 (2:0) | ||
| R (match retour) | Anorthosis Famagusta | - | Olympiakos Piraeus | 2:4 (1:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:30 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: Olympiakos Piraeus | ||||
| H (Match allé) | Bayern München | - | FK Obilić | 4:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | FK Obilić | - | Bayern München | 1:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:30 | R (match retour): 26.08.1998 20:30 | vainqueur: Bayern München | ||||
| H (Match allé) | Sturm Graz | - | Újpest FC | 4:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Újpest FC | - | Sturm Graz | 2:3 (1:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:30 | R (match retour): 26.08.1998 20:30 | vainqueur: Sturm Graz | ||||
| H (Match allé) | Manchester United | - | ŁKS Łódź | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | ŁKS Łódź | - | Manchester United | 0:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:45 | R (match retour): 26.08.1998 21:05 | vainqueur: Manchester United | ||||
| H (Match allé) | Celtic FC | - | Croatia Zagreb | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Croatia Zagreb | - | Celtic FC | 3:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:45 | R (match retour): 26.08.1998 20:30 | vainqueur: Croatia Zagreb | ||||
| H (Match allé) | Inter | - | Skonto FC | 4:0 (3:0) | ||
| R (match retour) | Skonto FC | - | Inter | 1:3 (1:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 20:45 | R (match retour): 26.08.1998 20:00 | vainqueur: Inter | ||||
| H (Match allé) | SL Benfica | - | Beitar Jerusalem | 6:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | Beitar Jerusalem | - | SL Benfica | 4:2 (2:1) | ||
| H (Match allé): 12.08.1998 22:00 | R (match retour): 26.08.1998 17:00 | vainqueur: SL Benfica | ||||
