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| H (Match allé) | Deportivo La Guaira | - | Emelec | 4:2 (2:0) | ||
| R (match retour) | Emelec | - | Deportivo La Guaira | 0:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 24.08.2016 00:15 | R (match retour): 14.09.2016 23:00 | vainqueur: Deportivo La Guaira | ||||
| H (Match allé) | Banfield | - | San Lorenzo | 2:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | San Lorenzo | - | Banfield | 4:1 (4:1) | ||
| H (Match allé): 24.08.2016 00:15 | R (match retour): 14.09.2016 00:15 | vainqueur: San Lorenzo | ||||
| H (Match allé) | Blooming | - | Atlético Junior | 0:2 (0:1) | ||
| R (match retour) | Atlético Junior | - | Blooming | 1:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 24.08.2016 02:45 | R (match retour): 15.09.2016 02:45 | vainqueur: Atlético Junior | ||||
| H (Match allé) | Real Garcilaso | - | Palestino | 2:2 (1:2) | ||
| R (match retour) | Palestino | - | Real Garcilaso | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 24.08.2016 22:00 | R (match retour): 16.09.2016 00:15 | vainqueur: Palestino | ||||
| H (Match allé) | Bolívar | - | Atlético Nacional | 1:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Atlético Nacional | - | Bolívar | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 00:15 | R (match retour): 14.09.2016 02:45 | vainqueur: Atlético Nacional | ||||
| H (Match allé) | Cerro Porteño | - | Real Potosí | 6:0 (4:0) | ||
| R (match retour) | Real Potosí | - | Cerro Porteño | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 00:15 | R (match retour): 16.09.2016 00:30 | vainqueur: Cerro Porteño | ||||
| H (Match allé) | Santa Cruz - PE | - | Sport Recife - PE | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Sport Recife - PE | - | Santa Cruz - PE | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 02:45 | R (match retour): 01.09.2016 02:45 | vainqueur: Santa Cruz - PE | ||||
| H (Match allé) | Estudiantes | - | Belgrano de Córdoba | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Belgrano de Córdoba | - | Estudiantes | 2:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 02:45 | R (match retour): 16.09.2016 02:45 | vainqueur: Belgrano de Córdoba | ||||
| H (Match allé) | Figueirense - SC | - | Flamengo RJ | 4:2 (3:1) | ||
| R (match retour) | Flamengo RJ | - | Figueirense - SC | 3:1 (2:1) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 02:45 | R (match retour): 01.09.2016 02:45 | vainqueur: Flamengo RJ | ||||
| H (Match allé) | Independiente Medellín | - | Sportivo Luqueño | 3:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Sportivo Luqueño | - | Independiente Medellín | 2:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 25.08.2016 02:45 | R (match retour): 16.09.2016 02:45 | vainqueur: Independiente Medellín | ||||
| H (Match allé) | Cuiabá - MT | - | Chapecoense | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Chapecoense | - | Cuiabá - MT | 3:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 26.08.2016 00:00 | R (match retour): 01.09.2016 02:45 | vainqueur: Chapecoense | ||||
| H (Match allé) | Lanús | - | Independiente | 0:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Independiente | - | Lanús | 1:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 26.08.2016 00:15 | R (match retour): 15.09.2016 00:15 | vainqueur: Independiente | ||||
| H (Match allé) | Zamora FC | - | Montevideo Wanderers | 0:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Montevideo Wanderers | - | Zamora FC | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 26.08.2016 02:45 | R (match retour): 14.09.2016 21:00 | vainqueur: Montevideo Wanderers | ||||
| H (Match allé) | Vitória - BA | - | Coritiba - PR | 2:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Coritiba - PR | - | Vitória - BA | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 26.08.2016 02:45 | R (match retour): 31.08.2016 22:00 | vainqueur: Coritiba - PR | ||||
| H (Match allé) | Sol de América | - | Sport Huancayo | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Sport Huancayo | - | Sol de América | 1:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 26.08.2016 02:45 | R (match retour): 15.09.2016 21:15 | vainqueur: Sol de América | ||||
