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| H (Match allé) | Tescoma Zlín | - | Slavia Praha | 0:0 | ||
| R (match retour) | Slavia Praha | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||
| H (Match allé): 08.04.2009 18:00 | R (match retour): 23.04.2009 18:00 | vainqueur: Slavia Praha | ||||
| H (Match allé) | 1. FC Slovácko | - | Baník Ostrava | 1:0 | ||
| R (match retour) | Baník Ostrava | - | 1. FC Slovácko | 1:1 | ||
| H (Match allé): 08.04.2009 18:00 | R (match retour): 22.04.2009 17:00 | vainqueur: 1. FC Slovácko | ||||
| H (Match allé) | FK Teplice | - | Slovan Liberec | 0:0 | ||
| R (match retour) | Slovan Liberec | - | FK Teplice | 0:2 | ||
| H (Match allé): 09.04.2009 17:30 | R (match retour): 22.04.2009 18:00 | vainqueur: FK Teplice | ||||
| H (Match allé) | AC Sparta Praha | - | Viktoria Plzeň | 0:0 | ||
| R (match retour) | Viktoria Plzeň | - | AC Sparta Praha | 0:3 | ||
| H (Match allé): 09.04.2009 18:00 | R (match retour): 22.04.2009 17:30 | vainqueur: AC Sparta Praha | ||||
