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| H (Match allé) | Lausanne Sports | - | Real Zaragoza | 1:2 (1:2) | ||
| R (match retour) | Real Zaragoza | - | Lausanne Sports | 3:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 06.11.1963 | R (match retour): 20.11.1963 | vainqueur: Real Zaragoza | ||||
| H (Match allé) | 1. FC Köln | - | Sheffield Wednesday | 3:2 (3:0) | ||
| R (match retour) | Sheffield Wednesday | - | 1. FC Köln | 1:2 (1:0) | ||
| H (Match allé): 06.11.1963 | R (match retour): 27.11.1963 | vainqueur: 1. FC Köln | ||||
| H (Match allé) | Rapid Wien | - | Valencia CF | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Valencia CF | - | Rapid Wien | 3:2 (1:1) | ||
| H (Match allé): 06.11.1963 | R (match retour): 27.11.1963 | vainqueur: Valencia CF | ||||
| H (Match allé) | Arsenal FC | - | RFC Liège | 1:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | RFC Liège | - | Arsenal FC | 3:1 (2:1) | ||
| H (Match allé): 13.11.1963 | R (match retour): 18.12.1963 | vainqueur: RFC Liège | ||||
| H (Match allé) | Partick Thistle | - | TJ Spartak ZJŠ Brno | 3:2 (2:0) | ||
| R (match retour) | TJ Spartak ZJŠ Brno | - | Partick Thistle | 4:0 (3:0) | ||
| H (Match allé): 18.11.1963 | R (match retour): 27.11.1963 | vainqueur: TJ Spartak ZJŠ Brno | ||||
| H (Match allé) | Újpesti Dózsa SC | - | Lokomotiv Plovdiv | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Lokomotiv Plovdiv | - | Újpesti Dózsa SC | 1:3 (0:1) | ||
| H (Match allé): 20.11.1963 | R (match retour): 27.11.1963 | vainqueur: Újpesti Dózsa SC | ||||
| H (Match allé) | AS Roma | - | Os Belenenses | 2:1 (1:0) | ||
| R (match retour) | Os Belenenses | - | AS Roma | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 04.12.1963 | R (match retour): 11.12.1963 | vainqueur: AS Roma | ||||
| H (Match allé) | Juventus | - | Atlético Madrid | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Atlético Madrid | - | Juventus | 1:2 (0:2) | ||
| H (Match allé): 04.12.1963 | R (match retour): 01.01.1964 | vainqueur: Juventus | ||||
