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| H (Match allé) | Brøndby IF | - | Sportul Studenţesc | 3:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | Sportul Studenţesc | - | Brøndby IF | 3:0 (1:0, 3:0, 3:0) tab | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Sportul Studenţesc | ||||
| H (Match allé) | Aberdeen FC | - | Feyenoord | 2:1 (1:1) | ||
| R (match retour) | Feyenoord | - | Aberdeen FC | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Feyenoord | ||||
| H (Match allé) | Dundee United | - | TJ Vítkovice | 1:2 (1:1) | ||
| R (match retour) | TJ Vítkovice | - | Dundee United | 1:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: TJ Vítkovice | ||||
| H (Match allé) | FC Barcelona | - | Dinamo Moskva | 2:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | Dinamo Moskva | - | FC Barcelona | 0:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: FC Barcelona | ||||
| H (Match allé) | Toulouse FC | - | Bayer Leverkusen | 1:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Bayer Leverkusen | - | Toulouse FC | 1:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Bayer Leverkusen | ||||
| H (Match allé) | Panathinaikos | - | Juventus | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Juventus | - | Panathinaikos | 3:2 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Panathinaikos | ||||
| H (Match allé) | AC Milan | - | Espanyol Barcelona | 0:2 (0:1) | ||
| R (match retour) | Espanyol Barcelona | - | AC Milan | 0:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Espanyol Barcelona | ||||
| H (Match allé) | Inter | - | TPS Turku | 0:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | TPS Turku | - | Inter | 0:2 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Inter | ||||
| H (Match allé) | FC Utrecht | - | Hellas Verona | 1:1 (1:1) | ||
| R (match retour) | Hellas Verona | - | FC Utrecht | 2:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Hellas Verona | ||||
| H (Match allé) | GD Chaves | - | Budapest Honved SE | 1:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | Budapest Honved SE | - | GD Chaves | 3:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Budapest Honved SE | ||||
| H (Match allé) | Vitória Guimarães | - | KSK Beveren | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | KSK Beveren | - | Vitória Guimarães | 4:5 (0:0, 1:0, 1:0) tab | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Vitória Guimarães | ||||
| H (Match allé) | Borussia Dortmund | - | Velež Mostar | 2:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Velež Mostar | - | Borussia Dortmund | 2:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Borussia Dortmund | ||||
| H (Match allé) | Victoria Bucuresti | - | Dinamo Tbilisi | 1:2 (0:2) | ||
| R (match retour) | Dinamo Tbilisi | - | Victoria Bucuresti | 0:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Dinamo Tbilisi | ||||
| H (Match allé) | Spartak Moskva | - | Werder Bremen | 4:1 (2:0) | ||
| R (match retour) | Werder Bremen | - | Spartak Moskva | 6:2 (3:0, 4:1) ap | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Werder Bremen | ||||
| H (Match allé) | Crvena Zvezda | - | Club Brugge KV | 3:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Club Brugge KV | - | Crvena Zvezda | 4:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Club Brugge KV | ||||
| H (Match allé) | BSG Wismut Aue | - | Flamurtari Vlorë | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Flamurtari Vlorë | - | BSG Wismut Aue | 2:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 21.10.1987 | R (match retour): 04.11.1987 | vainqueur: Flamurtari Vlorë | ||||
