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| H (Match allé) | FC Basel | - | UMF Grindavík | 3:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | UMF Grindavík | - | FC Basel | 0:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 15:00 | R (match retour): 08.07.2001 16:00 | vainqueur: FC Basel | ||||
| H (Match allé) | Slaven Belupo | - | SC Bastia | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | SC Bastia | - | Slaven Belupo | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 17:00 | R (match retour): 07.07.2001 20:00 | vainqueur: Slaven Belupo | ||||
| H (Match allé) | FK Pobeda | - | Çaykur Rizespor | 2:1 (1:1) | ||
| R (match retour) | Çaykur Rizespor | - | FK Pobeda | 0:2 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 18:00 | R (match retour): 07.07.2001 18:00 | vainqueur: FK Pobeda | ||||
| H (Match allé) | Dinamo Minsk | - | Hapoel Haifa | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Hapoel Haifa | - | Dinamo Minsk | 0:1 (0:1) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 19:00 | R (match retour): 08.07.2001 18:30 | vainqueur: Dinamo Minsk | ||||
| H (Match allé) | Čelik Zenica | - | KAA Gent | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | KAA Gent | - | Čelik Zenica | 2:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 20:00 | R (match retour): 07.07.2001 20:00 | vainqueur: KAA Gent | ||||
| H (Match allé) | ESTAC Troyes | - | WIT Georgia | 6:0 (3:0) | ||
| R (match retour) | WIT Georgia | - | ESTAC Troyes | 1:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 20:00 | R (match retour): 08.07.2001 20:00 | vainqueur: ESTAC Troyes | ||||
| H (Match allé) | Sturm Graz | - | Lausanne Sports | 0:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Lausanne Sports | - | Sturm Graz | 3:3 (1:1) | ||
| H (Match allé): 30.06.2001 20:00 | R (match retour): 07.07.2001 19:30 | vainqueur: Lausanne Sports | ||||
| H (Match allé) | Odense BK | - | AIK Solna | 2:2 (1:2) | ||
| R (match retour) | AIK Solna | - | Odense BK | 2:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 15:00 | R (match retour): 07.07.2001 17:00 | vainqueur: AIK Solna | ||||
| H (Match allé) | TSV 1860 München | - | FK Smederevo | 3:1 (1:0) | ||
| R (match retour) | FK Smederevo | - | TSV 1860 München | 2:3 (1:1) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 15:00 | R (match retour): 07.07.2001 17:30 | vainqueur: TSV 1860 München | ||||
| H (Match allé) | 1. FC Synot Stare Mesto | - | FC Universitatea Craiova | 3:2 (1:0) | ||
| R (match retour) | FC Universitatea Craiova | - | 1. FC Synot Stare Mesto | 2:2 (0:2) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 16:30 | R (match retour): 07.07.2001 18:00 | vainqueur: 1. FC Synot Stare Mesto | ||||
| H (Match allé) | Zagłębie Lubin | - | Sporting Lokeren | 2:2 (1:0) | ||
| R (match retour) | Sporting Lokeren | - | Zagłębie Lubin | 2:1 (1:0) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 17:00 | R (match retour): 07.07.2001 20:00 | vainqueur: Sporting Lokeren | ||||
| H (Match allé) | Paris Saint-Germain | - | FC Jazz Pori | 3:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | FC Jazz Pori | - | Paris Saint-Germain | 1:4 (0:2) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 18:00 | R (match retour): 08.07.2001 19:00 | vainqueur: Paris Saint-Germain | ||||
| H (Match allé) | FK Liepājas Metalurgs | - | sc Heerenveen | 3:2 (1:1) | ||
| R (match retour) | sc Heerenveen | - | FK Liepājas Metalurgs | 6:1 (2:1) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 18:00 | R (match retour): 07.07.2001 19:30 | vainqueur: sc Heerenveen | ||||
| H (Match allé) | Tiligul Tiraspol | - | Lombard FC Tatabanya | 1:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Lombard FC Tatabanya | - | Tiligul Tiraspol | 4:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 18:00 | R (match retour): 07.07.2001 17:00 | vainqueur: Lombard FC Tatabanya | ||||
| H (Match allé) | NK Publikum Celje | - | FK Artmedia Petržalka | 5:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | FK Artmedia Petržalka | - | NK Publikum Celje | 1:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 18:00 | R (match retour): 08.07.2001 18:00 | vainqueur: NK Publikum Celje | ||||
| H (Match allé) | Spartak Varna | - | Tavriya Simferopol (1958-2014) | 0:3 | ||
| R (match retour) | Tavriya Simferopol (1958-2014) | - | Spartak Varna | 2:2 (2:1) | ||
| H (Match allé): 01.07.2001 18:30 | R (match retour): 08.07.2001 19:00 | vainqueur: Tavriya Simferopol (1958-2014) | ||||
