5. Journée 18.09.1999 Eintracht Frankfurt - Bayern München 1:2
6. Journée 24.09.1999 Bayern München - VfB Stuttgart 0:1
7. Journée 02.10.1999 FC Schalke 04 - Bayern München 1:1
8. Journée 16.10.1999 Bayern München - Hertha BSC 3:1
11. Journée 06.11.1999 SSV Ulm 1846 - Bayern München 0:1
12. Journée 20.11.1999 Bayern München - SC Freiburg 6:1
13. Journée 27.11.1999 TSV 1860 München - Bayern München 1:0
14. Journée 04.12.1999 Bayern München - Borussia Dortmund 1:1
15. Journée 11.12.1999 Hansa Rostock - Bayern München 0:3
16. Journée 14.12.1999 Bayern München - Arminia Bielefeld 2:1
17. Journée 17.12.1999 Werder Bremen - Bayern München 0:2
18. Journée 06.02.2000 Hamburger SV - Bayern München 0:0
19. Journée 09.02.2000 Bayern München - Bayer Leverkusen 4:1
20. Journée 12.02.2000 SpVgg Unterhaching - Bayern München 0:2 carton jaune
21. Journée 19.02.2000 Bayern München - MSV Duisburg 4:1
22. Journée 26.02.2000 Bayern München - Eintracht Frankfurt 4:1
24. Journée 11.03.2000 Bayern München - FC Schalke 04 4:1
25. Journée 18.03.2000 Hertha BSC - Bayern München 1:1 carton jaune
26. Journée 25.03.2000 Bayern München - 1. FC Kaiserslautern 2:2
27. Journée 01.04.2000 VfL Wolfsburg - Bayern München 1:1
28. Journée 08.04.2000 Bayern München - SSV Ulm 1846 4:0
29. Journée 12.04.2000 SC Freiburg - Bayern München 1:2
30. Journée 15.04.2000 Bayern München - TSV 1860 München 1:2
31. Journée 23.04.2000 Borussia Dortmund - Bayern München 0:1
32. Journée 29.04.2000 Bayern München - Hansa Rostock 4:1
33. Journée 13.05.2000 Arminia Bielefeld - Bayern München 0:3
34. Journée 20.05.2000 Bayern München - Werder Bremen 3:1