1. Journée 05.03.2006 FC Tokyo - Oita Trinita 2:0
2. Journée 11.03.2006 Albirex Niigata - FC Tokyo 2:0
3. Journée 18.03.2006 FC Tokyo - Shimizu S-Pulse 0:1
5. Journée 26.03.2006 FC Tokyo - Kyoto Purple Sanga 2:1
6. Journée 01.04.2006 Yokohama F. Marinos - FC Tokyo 1:1 carton jaune
7. Journée 08.04.2006 FC Tokyo - Júbilo Iwata 3:1
8. Journée 15.04.2006 FC Tokyo - JEF United Chiba 2:3
9. Journée 22.04.2006 Gamba Osaka - FC Tokyo 1:0
10. Journée 29.04.2006 FC Tokyo - Nagoya Grampus Eight 2:1 carton jaune
11. Journée 03.05.2006 Ventforet Kofu - FC Tokyo 1:3
12. Journée 06.05.2006 FC Tokyo - Omiya Ardija 1:2
13. Journée 19.07.2006 Avispa Fukuoka - FC Tokyo 0:0 carton jaune
14. Journée 22.07.2006 FC Tokyo - Kashima Antlers 2:4
15. Journée 26.07.2006 Cerezo Osaka - FC Tokyo 1:5 but
16. Journée 29.07.2006 FC Tokyo - Sanfrecce Hiroshima 0:2
17. Journée 12.08.2006 Urawa Red Diamonds - FC Tokyo 4:0
18. Journée 20.08.2006 JEF United Chiba - FC Tokyo 3:4
19. Journée 23.08.2006 FC Tokyo - Avispa Fukuoka 5:1
20. Journée 26.08.2006 Shimizu S-Pulse - FC Tokyo 2:0
21. Journée 30.08.2006 FC Tokyo - Cerezo Osaka 2:3
22. Journée 09.09.2006 FC Tokyo - Ventforet Kofu 1:3
23. Journée 16.09.2006 Kyoto Purple Sanga - FC Tokyo 1:0
24. Journée 24.09.2006 Kashima Antlers - FC Tokyo 3:2 but
26. Journée 07.10.2006 Nagoya Grampus Eight - FC Tokyo 1:2
27. Journée 15.10.2006 Sanfrecce Hiroshima - FC Tokyo 5:2 but
28. Journée 22.10.2006 FC Tokyo - Gamba Osaka 3:2 carton jaune
30. Journée 11.11.2006 FC Tokyo - Kawasaki Frontale 5:4
31. Journée 18.11.2006 Júbilo Iwata - FC Tokyo 4:1
33. Journée 26.11.2006 FC Tokyo - Urawa Red Diamonds 0:0
34. Journée 02.12.2006 Oita Trinita - FC Tokyo 0:1