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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MFK Karviná | 12 | 10 | 1 | 1 | 24:2 | 22 | 31 |
| 2 |
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1. SC Znojmo | 12 | 10 | 1 | 1 | 29:12 | 17 | 31 |
| 3 |
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FC Hradec Králové | 12 | 8 | 4 | 0 | 24:6 | 18 | 28 |
| 4 |
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FK Baník Sokolov | 12 | 6 | 6 | 0 | 18:8 | 10 | 24 |
| 5 |
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FC Graffin Vlašim | 12 | 5 | 7 | 0 | 17:8 | 9 | 22 |
| 6 |
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FK Pardubice | 11 | 6 | 4 | 1 | 14:7 | 7 | 22 |
| 7 |
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SFC Opava | 12 | 5 | 5 | 2 | 19:13 | 6 | 20 |
| 8 |
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FK Ústí nad Labem | 11 | 5 | 4 | 2 | 21:13 | 8 | 19 |
| 9 |
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FK Fotbal Třinec | 12 | 4 | 6 | 2 | 17:9 | 8 | 18 |
| 10 |
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MFK Frýdek-Místek, a.s. | 11 | 5 | 3 | 3 | 18:18 | 0 | 18 |
| 11 |
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FK MAS Táborsko | 12 | 4 | 5 | 3 | 13:10 | 3 | 17 |
| 12 |
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FK Varnsdorf | 11 | 4 | 4 | 3 | 15:18 | -3 | 16 |
| 13 |
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Dynamo České Budějovice | 12 | 3 | 6 | 3 | 19:20 | -1 | 15 |
| 14 |
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Sigma Olomouc B | 11 | 3 | 4 | 4 | 11:12 | -1 | 13 |
| 15 |
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Slavoj Vyšehrad | 12 | 4 | 1 | 7 | 8:18 | -10 | 13 |
| Promotion | |
| Relégation |
