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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Ústí nad Labem | 9 | 8 | 1 | 0 | 19:6 | 13 | 25 |
| 2 |
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MFK Karviná | 11 | 8 | 1 | 2 | 20:10 | 10 | 25 |
| 3 |
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Tescoma Zlín | 10 | 8 | 1 | 1 | 17:4 | 13 | 25 |
| 4 |
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FK Baník Sokolov | 10 | 6 | 2 | 2 | 19:12 | 7 | 20 |
| 5 |
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Vysočina Jihlava | 10 | 6 | 1 | 3 | 18:11 | 7 | 19 |
| 6 |
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1. SC Znojmo | 10 | 6 | 1 | 3 | 14:8 | 6 | 19 |
| 7 |
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Zbrojovka Brno | 10 | 5 | 3 | 2 | 13:9 | 4 | 18 |
| 8 |
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SFC Opava | 11 | 5 | 2 | 4 | 21:15 | 6 | 17 |
| 9 |
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Bohemians Praha | 10 | 5 | 2 | 3 | 13:8 | 5 | 17 |
| 10 |
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FK Fotbal Třinec | 9 | 4 | 4 | 1 | 12:8 | 4 | 16 |
| 11 |
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FK MAS Táborsko | 10 | 5 | 1 | 4 | 13:10 | 3 | 16 |
| 12 |
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FK Baník Most | 11 | 4 | 3 | 4 | 12:15 | -3 | 15 |
| 13 |
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FK Varnsdorf | 10 | 3 | 4 | 3 | 16:15 | 1 | 13 |
| 14 |
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FC Graffin Vlašim | 10 | 3 | 4 | 3 | 17:11 | 6 | 13 |
| 15 |
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FK Čáslav | 9 | 3 | 3 | 3 | 9:9 | 0 | 12 |
| 16 |
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AC Sparta Praha B | 10 | 2 | 1 | 7 | 10:15 | -5 | 7 |
| Promotion | |
| Relégation |
