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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MFK Karviná | 12 | 9 | 1 | 2 | 22:10 | 12 | 28 |
| 2 |
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FK Ústí nad Labem | 11 | 8 | 2 | 1 | 21:9 | 12 | 26 |
| 3 |
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Tescoma Zlín | 12 | 8 | 1 | 3 | 18:7 | 11 | 25 |
| 4 |
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FK Baník Sokolov | 12 | 7 | 3 | 2 | 20:12 | 8 | 24 |
| 5 |
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Vysočina Jihlava | 12 | 7 | 2 | 3 | 22:14 | 8 | 23 |
| 6 |
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Zbrojovka Brno | 12 | 6 | 4 | 2 | 15:9 | 6 | 22 |
| 7 |
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FK Baník Most | 13 | 6 | 3 | 4 | 14:15 | -1 | 21 |
| 8 |
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1. SC Znojmo | 12 | 6 | 3 | 3 | 15:9 | 6 | 21 |
| 9 |
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Bohemians Praha | 12 | 6 | 2 | 4 | 18:10 | 8 | 20 |
| 10 |
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FK MAS Táborsko | 12 | 6 | 1 | 5 | 19:13 | 6 | 19 |
| 11 |
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FK Čáslav | 12 | 5 | 4 | 3 | 13:10 | 3 | 19 |
| 12 |
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SFC Opava | 12 | 5 | 2 | 5 | 21:17 | 4 | 17 |
| 13 |
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FK Varnsdorf | 12 | 4 | 5 | 3 | 19:17 | 2 | 17 |
| 14 |
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FK Fotbal Třinec | 12 | 4 | 4 | 4 | 14:16 | -2 | 16 |
| 15 |
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FC Graffin Vlašim | 12 | 3 | 4 | 5 | 19:17 | 2 | 13 |
| 16 |
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AC Sparta Praha B | 12 | 2 | 1 | 9 | 11:19 | -8 | 7 |
| Promotion | |
| Relégation |
