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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Ústí nad Labem | 13 | 10 | 2 | 1 | 24:9 | 15 | 32 |
| 2 |
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MFK Karviná | 13 | 9 | 2 | 2 | 23:11 | 12 | 29 |
| 3 |
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FK Baník Sokolov | 13 | 8 | 3 | 2 | 22:12 | 10 | 27 |
| 4 |
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Vysočina Jihlava | 13 | 8 | 2 | 3 | 25:14 | 11 | 26 |
| 5 |
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Tescoma Zlín | 13 | 8 | 2 | 3 | 19:8 | 11 | 26 |
| 6 |
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Zbrojovka Brno | 13 | 6 | 5 | 2 | 16:10 | 6 | 23 |
| 7 |
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1. SC Znojmo | 13 | 6 | 4 | 3 | 15:9 | 6 | 22 |
| 8 |
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FK Čáslav | 13 | 6 | 4 | 3 | 16:10 | 6 | 22 |
| 9 |
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FK Baník Most | 13 | 6 | 3 | 4 | 14:15 | -1 | 21 |
| 10 |
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Bohemians Praha | 13 | 6 | 2 | 5 | 19:12 | 7 | 20 |
| 11 |
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FK MAS Táborsko | 13 | 6 | 2 | 5 | 20:14 | 6 | 20 |
| 12 |
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SFC Opava | 13 | 5 | 3 | 5 | 23:19 | 4 | 18 |
| 13 |
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FK Varnsdorf | 13 | 4 | 5 | 4 | 20:19 | 1 | 17 |
| 14 |
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FK Fotbal Třinec | 13 | 4 | 4 | 5 | 15:18 | -3 | 16 |
| 15 |
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FC Graffin Vlašim | 13 | 4 | 4 | 5 | 22:18 | 4 | 16 |
| 16 |
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AC Sparta Praha B | 13 | 3 | 1 | 9 | 14:20 | -6 | 10 |
| Promotion | |
| Relégation |
