2. Journée 26.09.1999 AEK Athen - Panathinaikos 1:2
3. Journée 03.10.1999 Panathinaikos - PAOK Saloniki 1:1
4. Journée 17.10.1999 Panathinaikos - Kalamata 5:0 carton jaune
6. Journée 31.10.1999 Panathinaikos - Iraklis Saloniki 3:0
7. Journée 08.11.1999 Paniliakos Pyrgos - Panathinaikos 0:1
9. Journée 29.11.1999 Ionikos Nikea - Panathinaikos 2:2
11. Journée 13.12.1999 OFI Heraklion - Panathinaikos 3:4
12. Journée 23.12.1999 Skoda Xanthi - Panathinaikos 1:3
14. Journée 08.01.2000 AO Proodeftiki - Panathinaikos 1:0
15. Journée 17.01.2000 Panathinaikos - Panionios GSS 2:1 but
16. Journée 22.01.2000 Apollon Smyrnis - Panathinaikos 0:3 but
17. Journée 30.01.2000 Panathinaikos - AO Kavala 3:0
18. Journée 06.02.2000 AO Trikala - Panathinaikos 1:3
19. Journée 13.02.2000 Panathinaikos - AEK Athen 1:0
20. Journée 20.02.2000 PAOK Saloniki - Panathinaikos 1:3
21. Journée 28.02.2000 Kalamata - Panathinaikos 0:0
22. Journée 05.03.2000 Panathinaikos - Ethnikos Asteras 4:0 but
23. Journée 12.03.2000 Iraklis Saloniki - Panathinaikos 1:3
24. Journée 19.03.2000 Panathinaikos - Paniliakos Pyrgos 3:1 but
25. Journée 26.03.2000 Olympiakos Piraeus - Panathinaikos 2:2
27. Journée 12.04.2000 Aris Saloniki - Panathinaikos 0:2
28. Journée 17.04.2000 Panathinaikos - OFI Heraklion 3:2
29. Journée 22.04.2000 Panathinaikos - Skoda Xanthi 2:1
30. Journée 03.05.2000 Panachaiki GE - Panathinaikos 1:0 carton jaune
31. Journée 08.05.2000 Panathinaikos - AO Proodeftiki 3:1
32. Journée 14.05.2000 Panionios GSS - Panathinaikos 0:4 but
34. Journée 28.05.2000 AO Kavala - Panathinaikos 1:4