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| H (Match allé) | FK Senica | - | MŠK Žilina | 1:2 (0:0) | ||
| R (match retour) | MŠK Žilina | - | FK Senica | 4:2 (1:2, 1:2) tab | ||
| H (Match allé): 23.10.2012 16:30 | R (match retour): 06.11.2012 17:30 | vainqueur: MŠK Žilina | ||||
| H (Match allé) | FK Dukla Banská Bystrica | - | Spartak Trnava | 2:1 (0:0) | ||
| R (match retour) | Spartak Trnava | - | FK Dukla Banská Bystrica | 3:1 (2:0) | ||
| H (Match allé): 23.10.2012 17:00 | R (match retour): 06.11.2012 17:00 | vainqueur: Spartak Trnava | ||||
| H (Match allé) | MFK Košice | - | Spartak Myjava | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | Spartak Myjava | - | MFK Košice | 3:1 (2:1) | ||
| H (Match allé): 24.10.2012 16:00 | R (match retour): 06.11.2012 13:30 | vainqueur: MFK Košice | ||||
| H (Match allé) | Slovan Bratislava | - | MFK Ružomberok | 2:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | MFK Ružomberok | - | Slovan Bratislava | 3:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 24.10.2012 18:00 | R (match retour): 06.11.2012 16:30 | vainqueur: Slovan Bratislava | ||||
