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| Classement | équipe recevante | » à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Flora | 7 | 5 | 1 | 1 | 11:5 | 6 | 16 |
| 2 |
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JK Sillamäe Kalev | 8 | 5 | 0 | 3 | 17:6 | 11 | 15 |
| 3 |
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JK Nõmme Kalju | 7 | 5 | 0 | 2 | 13:5 | 8 | 15 |
| 4 |
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FC Infonet | 8 | 3 | 4 | 1 | 8:4 | 4 | 13 |
| 5 |
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FC Levadia | 5 | 3 | 2 | 0 | 13:7 | 6 | 11 |
| 6 |
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JK Narva Trans | 7 | 1 | 2 | 4 | 5:11 | -6 | 5 |
| 7 |
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Paide Linnameeskond | 8 | 1 | 2 | 5 | 10:17 | -7 | 5 |
| 8 |
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Tulevik Viljandi | 9 | 1 | 1 | 7 | 7:20 | -13 | 4 |
| 9 |
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JK Tammeka | 9 | 1 | 1 | 7 | 9:33 | -24 | 4 |
| 10 |
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Pärnu Linnameeskond | 7 | 0 | 1 | 6 | 5:19 | -14 | 1 |
| 11 |
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Rakvere JK Tarvas | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
