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| 23.06.2006 | 18:00 | FK Nevėžis | - | FK Šiauliai | 0:3 | |
| 18:00 | FK Ekranas | - | FK Zalgiris | 1:0 | ||
| 18:00 | FK Atlantas | - | FBK Kaunas | 1:2 | ||
| 18:00 | FK Šilutė | - | FK Sūduva | 0:3 | ||
| 25.07.2006 | 17:30 | FK Vetra | - | FK Vilnius | 1:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FBK Kaunas | 16 | 15 | 1 | 0 | 46:13 | 33 | 46 |
| 2 |
|
FK Ekranas | 16 | 8 | 5 | 3 | 24:11 | 13 | 29 |
| 3 |
|
FK Atlantas | 16 | 7 | 5 | 4 | 19:16 | 3 | 26 |
| 4 |
|
FK Šiauliai | 16 | 6 | 5 | 5 | 21:16 | 5 | 23 |
| 5 |
|
FK Sūduva | 16 | 6 | 5 | 5 | 18:16 | 2 | 23 |
| 6 |
|
FK Vetra | 16 | 5 | 7 | 4 | 16:18 | -2 | 22 |
| 7 |
|
FK Vilnius | 16 | 3 | 9 | 4 | 13:15 | -2 | 18 |
| 8 |
|
FK Zalgiris | 16 | 4 | 5 | 7 | 17:17 | 0 | 17 |
| 9 |
|
FK Šilutė | 16 | 2 | 3 | 11 | 10:28 | -18 | 9 |
| 10 |
|
FK Nevėžis | 16 | 1 | 1 | 14 | 9:43 | -34 | 4 |
