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| 27.10.2012 | 13:00 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 1:5 | |
| 17:00 | FK Banga Gargždai | - | FK Ekranas | 0:2 | ||
| 28.10.2012 | REO Vilnius | - | FK Kruoja Pakruojis | 0:3 | ||
| 15:10 | VMFD Žalgiris | - | FK Šiauliai | 4:1 | ||
| 17:00 | FK Dainava Alytus | - | FK Tauras Tauragė | 2:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Ekranas | 34 | 25 | 7 | 2 | 75:23 | 52 | 82 |
| 2 |
|
VMFD Žalgiris | 34 | 25 | 6 | 3 | 74:21 | 53 | 81 |
| 3 |
|
FK Sūduva | 34 | 20 | 6 | 8 | 73:36 | 37 | 66 |
| 4 |
|
FK Kruoja Pakruojis | 34 | 20 | 4 | 10 | 55:28 | 27 | 64 |
| 5 |
|
FK Šiauliai | 34 | 17 | 3 | 14 | 75:52 | 23 | 54 |
| 6 |
|
FK Banga Gargždai | 34 | 11 | 8 | 15 | 38:39 | -1 | 41 |
| 7 |
|
FK Dainava Alytus | 34 | 9 | 4 | 21 | 38:66 | -28 | 31 |
| 8 |
|
FK Atlantas | 34 | 6 | 6 | 22 | 27:85 | -58 | 24 |
| 9 |
|
FK Tauras Tauragė | 34 | 7 | 2 | 25 | 33:89 | -56 | 23 |
| 10 |
|
REO Vilnius | 34 | 5 | 4 | 25 | 26:75 | -49 | 19 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation |
