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| 25.10.2008 | 16:00 | MFK Ružomberok | - | 1. FC Tatran Prešov | 3:0 (1:0) | |
| 16:30 | MFK Košice | - | FK Dukla Banská Bystrica | 0:0 | ||
| 17:00 | Spartak Trnava | - | FC DAC 1904 | 1:1 (0:0) | ||
| 17:30 | FC Nitra | - | Zlaté Moravce | 1:2 (1:1) | ||
| 20:15 | Slovan Bratislava | - | MFK Dubnica | 3:1 (2:1) | ||
| 26.10.2008 | 17:15 | MŠK Žilina | - | FC Artmedia Petržalka | 3:1 (3:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
MŠK Žilina | 13 | 8 | 3 | 2 | 25:7 | 18 | 27 |
| 2 |
|
Slovan Bratislava | 13 | 8 | 3 | 2 | 25:11 | 14 | 27 |
| 3 |
|
MFK Košice | 13 | 7 | 4 | 2 | 21:15 | 6 | 25 |
| 4 |
|
Spartak Trnava | 13 | 6 | 5 | 2 | 17:10 | 7 | 23 |
| 5 |
|
FC DAC 1904 | 13 | 5 | 4 | 4 | 17:14 | 3 | 19 |
| 6 |
|
MFK Ružomberok | 13 | 4 | 5 | 4 | 16:13 | 3 | 17 |
| 7 |
|
1. FC Tatran Prešov | 13 | 5 | 2 | 6 | 16:25 | -9 | 17 |
| 8 |
|
FK Dukla Banská Bystrica | 13 | 3 | 4 | 6 | 8:12 | -4 | 13 |
| 9 |
|
FC Nitra | 13 | 4 | 1 | 8 | 12:26 | -14 | 13 |
| 10 |
|
FC Artmedia Petržalka | 13 | 3 | 3 | 7 | 15:20 | -5 | 12 |
| 11 |
|
MFK Dubnica | 13 | 3 | 2 | 8 | 16:22 | -6 | 11 |
| 12 |
|
Zlaté Moravce | 13 | 2 | 4 | 7 | 6:19 | -13 | 10 |
