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| 30.09.2008 | 16:00 | FC Levadia | - | JK Tallinna Kalev | 2:1 | |
| 16:00 | JK Narva Trans | - | JK Sillamäe Kalev | 0:3 | ||
| 17:45 | JK Maag Tammeka | - | Pärnu JK Vaprus | 1:0 | ||
| 17:45 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 1:2 | ||
| 17:45 | JK Nõmme Kalju | - | FC TVMK | 2:0 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 30 | 25 | 4 | 1 | 93:18 | 75 | 79 |
| 2 |
|
FC Flora | 30 | 24 | 5 | 1 | 95:22 | 73 | 77 |
| 3 |
|
FC TVMK | 30 | 18 | 5 | 7 | 78:39 | 39 | 59 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 30 | 13 | 7 | 10 | 53:50 | 3 | 46 |
| 5 |
|
JK Nõmme Kalju | 30 | 13 | 5 | 12 | 51:53 | -2 | 44 |
| 6 |
|
JK Sillamäe Kalev | 30 | 11 | 5 | 14 | 43:69 | -26 | 38 |
| 7 |
|
JK Maag Tammeka | 30 | 8 | 4 | 18 | 39:58 | -19 | 28 |
| 8 |
|
JK Tallinna Kalev | 30 | 6 | 5 | 19 | 33:56 | -23 | 23 |
| 9 |
|
Tulevik Viljandi | 30 | 5 | 4 | 21 | 24:71 | -47 | 19 |
| 10 |
|
Pärnu JK Vaprus | 30 | 5 | 0 | 25 | 32:105 | -73 | 15 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
