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| 24.10.2009 | 13:00 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 (0:1) | |
| 13:00 | Tulevik Viljandi | - | JK Narva Trans | 0:1 (0:1) | ||
| 13:00 | JK Tallinna Kalev | - | Paide Linnameeskond | 3:2 (2:1) | ||
| 13:00 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 3:0 (1:0) | ||
| 16:00 | JK Tammeka | - | FC Levadia | 0:2 (0:2) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 32 | 28 | 4 | 0 | 110:19 | 91 | 88 |
| 2 |
|
JK Sillamäe Kalev | 32 | 23 | 4 | 5 | 79:31 | 48 | 73 |
| 3 |
|
JK Narva Trans | 32 | 20 | 6 | 6 | 74:26 | 48 | 66 |
| 4 |
|
FC Flora | 32 | 18 | 6 | 8 | 65:29 | 36 | 60 |
| 5 |
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JK Nõmme Kalju | 31 | 13 | 8 | 10 | 59:40 | 19 | 47 |
| 6 |
|
Tulevik Viljandi | 32 | 12 | 6 | 14 | 40:44 | -4 | 42 |
| 7 |
|
Paide Linnameeskond | 32 | 6 | 4 | 22 | 19:85 | -66 | 22 |
| 8 |
|
FC Kuressaare | 31 | 6 | 3 | 22 | 19:90 | -71 | 21 |
| 9 |
|
JK Tammeka | 32 | 5 | 3 | 24 | 26:80 | -54 | 18 |
| 10 |
|
JK Tallinna Kalev | 32 | 4 | 4 | 24 | 28:75 | -47 | 16 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relégation | |
| Relégation |
