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| 04.08.2012 | 16:00 | FC Kuressaare | - | JK Tammeka | 3:2 (0:0) | |
| 16:00 | JK Tallinna Kalev | - | FC Flora | 1:1 (1:1) | ||
| 18:30 | FC Viljandi | - | FC Levadia | 0:5 (0:1) | ||
| 18:30 | Paide Linnameeskond | - | JK Sillamäe Kalev | 2:0 (1:0) | ||
| 06.08.2012 | 17:45 | JK Nõmme Kalju | - | JK Narva Trans | 1:0 (1:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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JK Nõmme Kalju | 22 | 19 | 2 | 1 | 54:7 | 47 | 59 |
| 2 |
|
FC Levadia | 22 | 16 | 6 | 0 | 54:6 | 48 | 54 |
| 3 |
|
FC Flora | 22 | 15 | 2 | 5 | 45:12 | 33 | 47 |
| 4 |
|
JK Sillamäe Kalev | 22 | 7 | 8 | 7 | 23:26 | -3 | 29 |
| 5 |
|
JK Narva Trans | 22 | 8 | 4 | 10 | 25:27 | -2 | 28 |
| 6 |
|
Paide Linnameeskond | 22 | 8 | 3 | 11 | 20:32 | -12 | 27 |
| 7 |
|
FC Kuressaare | 22 | 4 | 7 | 11 | 18:44 | -26 | 19 |
| 8 |
|
JK Tallinna Kalev | 22 | 4 | 6 | 12 | 19:48 | -29 | 18 |
| 9 |
|
FC Viljandi | 22 | 4 | 5 | 13 | 20:45 | -25 | 17 |
| 10 |
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JK Tammeka | 22 | 1 | 5 | 16 | 14:45 | -31 | 8 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
