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| 24.03.2012 | 13:00 | Paide Linnameeskond | - | FC Viljandi | 0:1 (0:1) | |
| 13:00 | JK Nõmme Kalju | - | JK Tallinna Kalev | 3:1 (2:0) | ||
| 13:00 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Levadia | 0:0 (0:0) | ||
| 16:00 | FC Flora | - | JK Tammeka | 4:0 (2:0) | ||
| 04.09.2012 | 17:00 | JK Narva Trans | - | FC Kuressaare | 1:2 (1:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Flora | 3 | 3 | 0 | 0 | 8:0 | 8 | 9 |
| 2 |
|
JK Nõmme Kalju | 3 | 2 | 1 | 0 | 4:1 | 3 | 7 |
| 3 |
|
JK Tallinna Kalev | 3 | 2 | 0 | 1 | 4:4 | 0 | 6 |
| 4 |
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FC Levadia | 3 | 1 | 2 | 0 | 4:0 | 4 | 5 |
| 5 |
|
Paide Linnameeskond | 3 | 1 | 0 | 2 | 2:3 | -1 | 3 |
| 6 |
|
FC Viljandi | 3 | 1 | 0 | 2 | 2:4 | -2 | 3 |
| 7 |
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JK Narva Trans | 3 | 1 | 0 | 2 | 3:6 | -3 | 3 |
| 8 |
|
FC Kuressaare | 3 | 1 | 0 | 2 | 3:4 | -1 | 3 |
| 9 |
|
JK Sillamäe Kalev | 3 | 0 | 2 | 1 | 0:2 | -2 | 2 |
| 10 |
|
JK Tammeka | 3 | 0 | 1 | 2 | 0:6 | -6 | 1 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
