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| 27.04.2013 | 13:00 | FK Sūduva | - | VMFD Žalgiris | 0:5 | |
| 17:30 | FK Banga Gargždai | - | FK Atlantas | 0:1 | ||
| 28.04.2013 | 12:00 | FK Ekranas | - | FK Tauras Tauragė | 2:1 | |
| 16:00 | FK Kruoja Pakruojis | - | FK Šiauliai | 1:1 |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Atlantas | 8 | 7 | 0 | 1 | 16:6 | 10 | 21 |
| 2 |
|
VMFD Žalgiris | 8 | 6 | 1 | 1 | 17:4 | 13 | 19 |
| 3 |
|
FK Ekranas | 8 | 5 | 1 | 2 | 20:11 | 9 | 16 |
| 4 |
|
FK Kruoja Pakruojis | 8 | 4 | 2 | 2 | 12:10 | 2 | 14 |
| 5 |
|
FK Šiauliai | 8 | 3 | 3 | 2 | 12:11 | 1 | 12 |
| 6 |
|
FK Sūduva | 8 | 3 | 2 | 3 | 14:11 | 3 | 11 |
| 7 |
|
FK Banga Gargždai | 8 | 1 | 1 | 6 | 6:17 | -11 | 4 |
| 8 |
|
FK Dainava Alytus | 8 | 1 | 1 | 6 | 6:20 | -14 | 4 |
| 9 |
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FK Tauras Tauragė | 8 | 0 | 1 | 7 | 5:18 | -13 | 1 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. |
