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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Augsburg | 26 | 15 | 8 | 3 | 29:10 | 19 | 53 |
| 2 |
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Hertha BSC | 26 | 14 | 5 | 7 | 29:13 | 16 | 47 |
| 3 |
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Energie Cottbus | 26 | 13 | 6 | 7 | 31:18 | 13 | 45 |
| 4 |
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MSV Duisburg | 26 | 11 | 9 | 6 | 25:14 | 11 | 42 |
| 5 |
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SpVgg Greuther Fürth | 26 | 12 | 6 | 8 | 21:14 | 7 | 42 |
| 6 |
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VfL Bochum | 26 | 10 | 9 | 7 | 19:15 | 4 | 39 |
| 7 |
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Erzgebirge Aue | 26 | 10 | 8 | 8 | 20:21 | -1 | 38 |
| 8 |
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TSV 1860 München | 26 | 8 | 12 | 6 | 19:16 | 3 | 36 |
| 9 |
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Alemannia Aachen | 26 | 7 | 13 | 6 | 23:22 | 1 | 34 |
| 10 |
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VfL Osnabrück | 26 | 10 | 4 | 12 | 21:26 | -5 | 34 |
| 11 |
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1. FC Union Berlin | 26 | 8 | 8 | 10 | 17:19 | -2 | 32 |
| 12 |
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Fortuna Düsseldorf | 26 | 8 | 8 | 10 | 17:23 | -6 | 32 |
| 13 |
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FSV Frankfurt | 26 | 7 | 7 | 12 | 22:26 | -4 | 28 |
| 14 |
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SC Paderborn 07 | 26 | 7 | 7 | 12 | 17:23 | -6 | 28 |
| 15 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 26 | 7 | 7 | 12 | 13:27 | -14 | 28 |
| 16 |
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Arminia Bielefeld | 26 | 5 | 10 | 11 | 15:24 | -9 | 25 |
| 17 |
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FC Ingolstadt 04 | 26 | 5 | 8 | 13 | 17:27 | -10 | 23 |
| 18 |
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Karlsruher SC | 26 | 4 | 11 | 11 | 18:35 | -17 | 23 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
