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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Augsburg | 30 | 17 | 10 | 3 | 32:10 | 22 | 61 |
| 2 |
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Hertha BSC | 30 | 16 | 7 | 7 | 33:14 | 19 | 55 |
| 3 |
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Energie Cottbus | 30 | 15 | 6 | 9 | 35:22 | 13 | 51 |
| 4 |
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SpVgg Greuther Fürth | 30 | 14 | 8 | 8 | 24:14 | 10 | 50 |
| 5 |
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MSV Duisburg | 30 | 13 | 9 | 8 | 29:19 | 10 | 48 |
| 6 |
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Erzgebirge Aue | 30 | 12 | 9 | 9 | 25:22 | 3 | 45 |
| 7 |
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TSV 1860 München | 30 | 10 | 13 | 7 | 24:20 | 4 | 43 |
| 8 |
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VfL Bochum | 30 | 11 | 10 | 9 | 20:17 | 3 | 43 |
| 9 |
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1. FC Union Berlin | 30 | 11 | 8 | 11 | 22:20 | 2 | 41 |
| 10 |
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Fortuna Düsseldorf | 30 | 11 | 8 | 11 | 21:25 | -4 | 41 |
| 11 |
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Alemannia Aachen | 30 | 8 | 14 | 8 | 28:30 | -2 | 38 |
| 12 |
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VfL Osnabrück | 30 | 10 | 6 | 14 | 23:32 | -9 | 36 |
| 13 |
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FSV Frankfurt | 30 | 9 | 8 | 13 | 25:28 | -3 | 35 |
| 14 |
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SC Paderborn 07 | 30 | 7 | 9 | 14 | 18:27 | -9 | 30 |
| 15 |
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Arminia Bielefeld | 30 | 6 | 11 | 13 | 18:29 | -11 | 29 |
| 16 |
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FC Ingolstadt 04 | 30 | 6 | 10 | 14 | 20:30 | -10 | 28 |
| 17 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 30 | 7 | 7 | 16 | 16:35 | -19 | 28 |
| 18 |
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Karlsruher SC | 30 | 4 | 13 | 13 | 20:39 | -19 | 25 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
