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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SpVgg Greuther Fürth | 31 | 18 | 9 | 4 | 36:17 | 19 | 63 |
| 2 |
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1. FC Köln | 31 | 18 | 8 | 5 | 29:11 | 18 | 62 |
| 3 |
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1. FC Kaiserslautern | 31 | 13 | 13 | 5 | 28:15 | 13 | 52 |
| 4 |
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SC Paderborn 07 | 31 | 15 | 4 | 12 | 37:30 | 7 | 49 |
| 5 |
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TSV 1860 München | 31 | 13 | 8 | 10 | 21:18 | 3 | 47 |
| 6 |
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Erzgebirge Aue | 31 | 11 | 12 | 8 | 22:19 | 3 | 45 |
| 7 |
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Karlsruher SC | 31 | 10 | 9 | 12 | 23:23 | 0 | 39 |
| 8 |
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FC St. Pauli | 31 | 9 | 12 | 10 | 25:29 | -4 | 39 |
| 9 |
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1. FC Union Berlin | 31 | 11 | 6 | 14 | 25:30 | -5 | 39 |
| 10 |
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Fortuna Düsseldorf | 31 | 9 | 12 | 10 | 20:25 | -5 | 39 |
| 11 |
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Dynamo Dresden | 31 | 7 | 17 | 7 | 19:23 | -4 | 38 |
| 12 |
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FC Ingolstadt 04 | 31 | 8 | 13 | 10 | 16:17 | -1 | 37 |
| 13 |
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VfL Bochum | 31 | 8 | 11 | 12 | 14:22 | -8 | 35 |
| 14 |
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Arminia Bielefeld | 31 | 8 | 10 | 13 | 24:30 | -6 | 34 |
| 15 |
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VfR Aalen | 31 | 5 | 18 | 8 | 17:17 | 0 | 33 |
| 16 |
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SV Sandhausen | 31 | 7 | 12 | 12 | 13:22 | -9 | 33 |
| 17 |
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FSV Frankfurt | 31 | 6 | 11 | 14 | 21:28 | -7 | 29 |
| 18 |
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Energie Cottbus | 31 | 5 | 11 | 15 | 14:28 | -14 | 26 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
