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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Köln | 18 | 11 | 1 | 6 | 30:15 | 15 | 34 |
| 2 |
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FC St. Pauli | 18 | 10 | 3 | 5 | 19:11 | 8 | 33 |
| 3 |
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Jahn Regensburg | 18 | 8 | 7 | 3 | 15:9 | 6 | 31 |
| 4 |
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Hamburger SV | 18 | 8 | 7 | 3 | 15:11 | 4 | 31 |
| 5 |
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Holstein Kiel | 18 | 8 | 6 | 4 | 22:16 | 6 | 30 |
| 6 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 18 | 7 | 8 | 3 | 16:11 | 5 | 29 |
| 7 |
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1. FC Union Berlin | 18 | 7 | 7 | 4 | 15:10 | 5 | 28 |
| 8 |
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SC Paderborn 07 | 18 | 7 | 6 | 5 | 28:19 | 9 | 27 |
| 9 |
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SpVgg Greuther Fürth | 18 | 6 | 6 | 6 | 19:19 | 0 | 24 |
| 10 |
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Erzgebirge Aue | 18 | 6 | 5 | 7 | 14:13 | 1 | 23 |
| 11 |
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VfL Bochum | 18 | 6 | 5 | 7 | 15:15 | 0 | 23 |
| 12 |
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SV Darmstadt 98 | 18 | 6 | 4 | 8 | 15:23 | -8 | 22 |
| 13 |
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Dynamo Dresden | 18 | 4 | 9 | 5 | 10:16 | -6 | 21 |
| 14 |
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MSV Duisburg | 18 | 4 | 6 | 8 | 10:22 | -12 | 18 |
| 15 |
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1. FC Magdeburg | 18 | 4 | 4 | 10 | 13:21 | -8 | 16 |
| 16 |
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Arminia Bielefeld | 18 | 3 | 7 | 8 | 11:20 | -9 | 16 |
| 17 |
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SV Sandhausen | 18 | 3 | 6 | 9 | 10:15 | -5 | 15 |
| 18 |
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FC Ingolstadt 04 | 18 | 1 | 9 | 8 | 11:22 | -11 | 12 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
