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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Köln | 20 | 11 | 3 | 6 | 30:15 | 15 | 36 |
| 2 |
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Holstein Kiel | 20 | 10 | 6 | 4 | 24:16 | 8 | 36 |
| 3 |
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Jahn Regensburg | 20 | 9 | 7 | 4 | 17:10 | 7 | 34 |
| 4 |
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FC St. Pauli | 20 | 10 | 4 | 6 | 21:15 | 6 | 34 |
| 5 |
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Hamburger SV | 20 | 8 | 9 | 3 | 16:12 | 4 | 33 |
| 6 |
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SC Paderborn 07 | 20 | 8 | 6 | 6 | 31:21 | 10 | 30 |
| 7 |
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1. FC Union Berlin | 20 | 7 | 9 | 4 | 17:12 | 5 | 30 |
| 8 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 20 | 7 | 9 | 4 | 16:12 | 4 | 30 |
| 9 |
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SV Darmstadt 98 | 20 | 8 | 4 | 8 | 19:24 | -5 | 28 |
| 10 |
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Erzgebirge Aue | 20 | 6 | 7 | 7 | 14:13 | 1 | 25 |
| 11 |
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SpVgg Greuther Fürth | 20 | 6 | 6 | 8 | 19:23 | -4 | 24 |
| 12 |
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VfL Bochum | 20 | 6 | 5 | 9 | 15:19 | -4 | 23 |
| 13 |
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Dynamo Dresden | 20 | 4 | 10 | 6 | 10:19 | -9 | 22 |
| 14 |
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MSV Duisburg | 20 | 5 | 6 | 9 | 12:24 | -12 | 21 |
| 15 |
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Arminia Bielefeld | 20 | 4 | 8 | 8 | 14:20 | -6 | 20 |
| 16 |
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1. FC Magdeburg | 20 | 5 | 5 | 10 | 14:21 | -7 | 20 |
| 17 |
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SV Sandhausen | 20 | 4 | 7 | 9 | 14:16 | -2 | 19 |
| 18 |
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FC Ingolstadt 04 | 20 | 2 | 9 | 9 | 12:23 | -11 | 15 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
