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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Ingolstadt 04 II | 23 | 12 | 8 | 3 | 24:11 | 13 | 44 |
| 2 |
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Wacker Burghausen | 23 | 10 | 12 | 1 | 14:5 | 9 | 42 |
| 3 |
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Jahn Regensburg | 23 | 9 | 10 | 4 | 23:15 | 8 | 37 |
| 4 |
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Bayern München II | 23 | 8 | 11 | 4 | 19:9 | 10 | 35 |
| 5 |
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SpVgg Bayreuth | 23 | 9 | 8 | 6 | 21:17 | 4 | 35 |
| 6 |
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FV Illertissen | 23 | 8 | 10 | 5 | 19:13 | 6 | 34 |
| 7 |
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FC Amberg | 23 | 7 | 11 | 5 | 15:11 | 4 | 32 |
| 8 |
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TSV 1896 Rain | 23 | 8 | 7 | 8 | 17:19 | -2 | 31 |
| 9 |
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1. FC Nürnberg II | 23 | 8 | 7 | 8 | 16:18 | -2 | 31 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 23 | 7 | 9 | 7 | 16:12 | 4 | 30 |
| 11 |
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TSV 1860 München II | 23 | 7 | 8 | 8 | 13:9 | 4 | 29 |
| 12 |
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FC Augsburg II | 23 | 6 | 9 | 8 | 16:23 | -7 | 27 |
| 13 |
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Viktoria Aschaffenburg | 23 | 6 | 7 | 10 | 14:24 | -10 | 25 |
| 14 |
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FC Memmingen | 23 | 6 | 6 | 11 | 12:19 | -7 | 24 |
| 15 |
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1. FC Schweinfurt 05 | 23 | 3 | 13 | 7 | 11:16 | -5 | 22 |
| 16 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 23 | 4 | 9 | 10 | 15:23 | -8 | 21 |
| 17 |
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SV Schalding-Heining | 23 | 2 | 14 | 7 | 8:15 | -7 | 20 |
| 18 |
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TSV Buchbach | 23 | 2 | 11 | 10 | 9:23 | -14 | 17 |
| Play-off | |
| Relégation | |
| Relégation |
