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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SpVgg Unterhaching | 20 | 13 | 7 | 0 | 30:2 | 28 | 46 |
| 2 |
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FC Augsburg II | 20 | 10 | 7 | 3 | 22:8 | 14 | 37 |
| 3 |
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FC Memmingen | 20 | 10 | 6 | 4 | 22:12 | 10 | 36 |
| 4 |
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Bayern München II | 20 | 9 | 8 | 3 | 14:5 | 9 | 35 |
| 5 |
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Wacker Burghausen | 20 | 8 | 6 | 6 | 13:11 | 2 | 30 |
| 6 |
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1. FC Schweinfurt 05 | 20 | 8 | 5 | 7 | 16:14 | 2 | 29 |
| 7 |
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FC Ingolstadt 04 II | 20 | 7 | 7 | 6 | 12:13 | -1 | 28 |
| 8 |
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SpVgg Bayreuth | 20 | 7 | 5 | 8 | 15:19 | -4 | 26 |
| 9 |
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1. FC Nürnberg II | 20 | 6 | 7 | 7 | 20:19 | 1 | 25 |
| 10 |
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FV Illertissen | 20 | 6 | 6 | 8 | 14:17 | -3 | 24 |
| 11 |
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SV Seligenporten | 20 | 5 | 9 | 6 | 11:17 | -6 | 24 |
| 12 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 20 | 4 | 11 | 5 | 15:14 | 1 | 23 |
| 13 |
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TSV 1860 Rosenheim | 20 | 4 | 11 | 5 | 6:9 | -3 | 23 |
| 14 |
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SV Schalding-Heining | 20 | 5 | 8 | 7 | 12:17 | -5 | 23 |
| 15 |
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TSV 1860 München II | 20 | 4 | 8 | 8 | 9:12 | -3 | 20 |
| 16 |
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VfR Garching | 20 | 5 | 4 | 11 | 14:26 | -12 | 19 |
| 17 |
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TSV Buchbach | 20 | 4 | 4 | 12 | 10:24 | -14 | 16 |
| 18 |
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SpVgg Bayern Hof | 20 | 3 | 5 | 12 | 12:28 | -16 | 14 |
| Play-off | |
| Relégation | |
| Relégation |
