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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SpVgg Unterhaching | 25 | 15 | 9 | 1 | 37:10 | 27 | 54 |
| 2 |
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TSV 1860 München II | 25 | 13 | 7 | 5 | 21:11 | 10 | 46 |
| 3 |
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VfR Garching | 25 | 11 | 7 | 7 | 28:20 | 8 | 40 |
| 4 |
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FC Augsburg II | 25 | 10 | 9 | 6 | 22:14 | 8 | 39 |
| 5 |
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SpVgg Bayreuth | 25 | 10 | 9 | 6 | 23:17 | 6 | 39 |
| 6 |
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1. FC Schweinfurt 05 | 25 | 10 | 9 | 6 | 26:23 | 3 | 39 |
| 7 |
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1. FC Nürnberg II | 25 | 10 | 7 | 8 | 30:29 | 1 | 37 |
| 8 |
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FC Memmingen | 25 | 8 | 10 | 7 | 23:17 | 6 | 34 |
| 9 |
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Wacker Burghausen | 25 | 8 | 9 | 8 | 23:22 | 1 | 33 |
| 10 |
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TSV 1860 Rosenheim | 25 | 9 | 6 | 10 | 22:26 | -4 | 33 |
| 11 |
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Bayern München II | 25 | 7 | 11 | 7 | 20:18 | 2 | 32 |
| 12 |
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FV Illertissen | 25 | 7 | 11 | 7 | 13:15 | -2 | 32 |
| 13 |
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TSV Buchbach | 25 | 7 | 8 | 10 | 18:22 | -4 | 29 |
| 14 |
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FC Ingolstadt 04 II | 25 | 7 | 6 | 12 | 19:28 | -9 | 27 |
| 15 |
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SV Schalding-Heining | 25 | 5 | 9 | 11 | 18:25 | -7 | 24 |
| 16 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 25 | 6 | 6 | 13 | 12:23 | -11 | 24 |
| 17 |
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SV Seligenporten | 25 | 5 | 6 | 14 | 18:37 | -19 | 21 |
| 18 |
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SpVgg Bayern Hof | 25 | 4 | 7 | 14 | 14:30 | -16 | 19 |
| Play-off | |
| Relégation | |
| Relégation |
