2. Bundesliga   M. G. N. P. Buts
  à domicile 2 2 0 0 6 : 1
  à l'extérieur 2 1 0 1 3 : 6
  4 3 0 1 9 : 7
2. Bundesliga Süd (-2018)   M. G. N. P. Buts
  à domicile 7 6 0 1 19 : 8
  à l'extérieur 7 7 0 0 16 : 0
  14 13 0 1 35 : 8
au total   M. G. N. P. Buts
  à domicile 9 8 0 1 25 : 9
  à l'extérieur 9 8 0 1 19 : 6
  Lieu neutre 0 0 0 0 0 : 0
  18 16 0 2 44 : 15
2. Bundesliga
2020/2021 Süd 11. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 3:0 (0:0)
2020/2021 Süd 2. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 1:3 (0:2)
2018/2019 17. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 5:0 (4:0)
2018/2019 4. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 3:1 (3:1)
2. Bundesliga Süd (-2018)
2016/2017 15. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:4 (0:1)
2016/2017 4. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 1:2 (1:1)
2014/2015 22. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 3:2 (1:1)
2014/2015 11. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:1 (0:1)
2013/2014 22. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 2:0 (1:0)
2013/2014 11. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:4 (0:0)
2012/2013 15. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:1 (0:0)
2012/2013 4. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 3:2 (3:1)
2011/2012 12. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 2:1
2011/2012 1. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:1
2010/2011 14. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:3
2010/2011 3. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 4:1
2009/2010 13. Journée Bayern München II - 1. FC Köln 0:2
2009/2010 2. Journée 1. FC Köln - Bayern München II 4:0

Pour les matchs qui ont été décidées aux tirs au but , le score est inclus dans ce classement après 120 minutes .