1. Journée 04.08.2006 Werder Bremen II - SV Wilhelmshaven 2:1 carton jaune
2. Journée 09.08.2006 Bayer Leverkusen II - Werder Bremen II 3:3 carton jaune
3. Journée 12.08.2006 Werder Bremen II - Kickers Emden 2:1 but
4. Journée 19.08.2006 FC St. Pauli - Werder Bremen II 2:1 but
5. Journée 26.08.2006 Werder Bremen II - Hamburger SV II 3:1 but carton jaune
6. Journée 02.09.2006 Holstein Kiel - Werder Bremen II 2:2
7. Journée 10.09.2006 Werder Bremen II - Bor. Mönchengladbach II 2:0
8. Journée 16.09.2006 Rot Weiss Ahlen - Werder Bremen II 2:0 carton jaune
9. Journée 23.09.2006 Werder Bremen II - VfL Osnabrück 3:1 carton jaune
11. Journée 14.10.2006 Werder Bremen II - Rot-Weiß Erfurt 0:1
12. Journée 21.10.2006 Dynamo Dresden - Werder Bremen II 1:4
13. Journée 28.10.2006 Werder Bremen II - 1. FC Magdeburg 2:2 carton jaune
15. Journée 08.11.2006 Werder Bremen II - Borussia Dortmund II 0:1 carton jaune
16. Journée 11.11.2006 VfB Lübeck - Werder Bremen II 0:2
18. Journée 26.11.2006 Werder Bremen II - Hertha BSC II 0:1
19. Journée 01.12.2006 1. FC Union Berlin - Werder Bremen II 0:2 but
22. Journée 17.02.2007 Kickers Emden - Werder Bremen II 4:2
21. Journée 28.02.2007 Werder Bremen II - Bayer Leverkusen II 1:0
26. Journée 17.03.2007 Bor. Mönchengladbach II - Werder Bremen II 2:3
27. Journée 24.03.2007 Werder Bremen II - Rot Weiss Ahlen 0:2
28. Journée 27.03.2007 VfL Osnabrück - Werder Bremen II 0:0
29. Journée 31.03.2007 Werder Bremen II - Fortuna Düsseldorf 2:0
30. Journée 07.04.2007 Rot-Weiß Erfurt - Werder Bremen II 1:1
31. Journée 14.04.2007 Werder Bremen II - Dynamo Dresden 1:1
32. Journée 20.04.2007 1. FC Magdeburg - Werder Bremen II 2:0 carton jaune
23. Journée 24.04.2007 Werder Bremen II - FC St. Pauli 0:2
33. Journée 28.04.2007 Werder Bremen II - Wuppertaler SV 1:2 carton jaune
34. Journée 06.05.2007 Borussia Dortmund II - Werder Bremen II 1:0
35. Journée 13.05.2007 Werder Bremen II - VfB Lübeck 2:0
37. Journée 27.05.2007 Hertha BSC II - Werder Bremen II 0:1
38. Journée 02.06.2007 Werder Bremen II - 1. FC Union Berlin 3:2