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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Köln | 24 | 12 | 9 | 3 | 21:11 | 10 | 45 |
| 2 |
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1. FC Union Berlin | 24 | 11 | 9 | 4 | 18:7 | 11 | 42 |
| 3 |
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Hamburger SV | 24 | 8 | 12 | 4 | 13:11 | 2 | 36 |
| 4 |
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SC Paderborn 07 | 24 | 8 | 10 | 6 | 19:13 | 6 | 34 |
| 5 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 24 | 8 | 10 | 6 | 19:15 | 4 | 34 |
| 6 |
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Arminia Bielefeld | 24 | 8 | 9 | 7 | 17:14 | 3 | 33 |
| 7 |
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FC St. Pauli | 24 | 6 | 15 | 3 | 15:13 | 2 | 33 |
| 8 |
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Dynamo Dresden | 24 | 8 | 9 | 7 | 17:16 | 1 | 33 |
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VfL Bochum | 24 | 8 | 9 | 7 | 17:16 | 1 | 33 | |
| 10 |
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Holstein Kiel | 24 | 7 | 11 | 6 | 18:13 | 5 | 32 |
| 11 |
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Erzgebirge Aue | 24 | 5 | 12 | 7 | 13:14 | -1 | 27 |
| 12 |
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1. FC Magdeburg | 24 | 4 | 14 | 6 | 12:15 | -3 | 26 |
| 13 |
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SV Darmstadt 98 | 24 | 5 | 11 | 8 | 10:16 | -6 | 26 |
| 14 |
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FC Ingolstadt 04 | 24 | 4 | 13 | 7 | 9:14 | -5 | 25 |
| 15 |
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SV Sandhausen | 24 | 5 | 10 | 9 | 10:16 | -6 | 25 |
| 16 |
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MSV Duisburg | 24 | 4 | 12 | 8 | 9:14 | -5 | 24 |
| 17 |
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Jahn Regensburg | 24 | 4 | 10 | 10 | 17:23 | -6 | 22 |
| 18 |
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SpVgg Greuther Fürth | 24 | 1 | 15 | 8 | 2:15 | -13 | 18 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
