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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Köln | 24 | 13 | 4 | 7 | 38:19 | 19 | 43 |
| 2 |
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FC St. Pauli | 24 | 12 | 4 | 8 | 23:19 | 4 | 40 |
| 3 |
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Hamburger SV | 24 | 10 | 10 | 4 | 19:15 | 4 | 40 |
| 4 |
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Jahn Regensburg | 24 | 10 | 9 | 5 | 20:12 | 8 | 39 |
| 5 |
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1. FC Union Berlin | 24 | 10 | 9 | 5 | 21:14 | 7 | 39 |
| 6 |
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Holstein Kiel | 24 | 10 | 8 | 6 | 26:20 | 6 | 38 |
| 7 |
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SC Paderborn 07 | 24 | 10 | 6 | 8 | 35:24 | 11 | 36 |
| 8 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 24 | 7 | 13 | 4 | 19:15 | 4 | 34 |
| 9 |
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SV Darmstadt 98 | 24 | 9 | 7 | 8 | 21:25 | -4 | 34 |
| 10 |
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Erzgebirge Aue | 24 | 8 | 8 | 8 | 17:15 | 2 | 32 |
| 11 |
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VfL Bochum | 24 | 9 | 5 | 10 | 18:20 | -2 | 32 |
| 12 |
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SpVgg Greuther Fürth | 24 | 7 | 8 | 9 | 22:26 | -4 | 29 |
| 13 |
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Arminia Bielefeld | 24 | 6 | 10 | 8 | 17:21 | -4 | 28 |
| 14 |
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Dynamo Dresden | 24 | 5 | 11 | 8 | 11:21 | -10 | 26 |
| 15 |
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MSV Duisburg | 24 | 6 | 7 | 11 | 14:27 | -13 | 25 |
| 16 |
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1. FC Magdeburg | 24 | 5 | 7 | 12 | 15:24 | -9 | 22 |
| 17 |
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SV Sandhausen | 24 | 4 | 8 | 12 | 14:22 | -8 | 20 |
| 18 |
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FC Ingolstadt 04 | 24 | 3 | 10 | 11 | 15:26 | -11 | 19 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
